מסמך פנימי של המטה לביטחון לאומי (מל"ל) שנחשף הבוקר (ראשון) בגלי צה"ל מציג שורה של כשלים בטיפול באבטחת הטיסות הזרות לישראל. מהמסמך עולה כי משרד התחבורה לא מימש את האחריות שהוטלה עליו, למרות התרעות מפורשות בנושא. גורמי המקצוע באגף הביטחון במשרד התנגדו נחרצות לקבלת האחריות וטענו כי אין בידיהם את היכולות הנדרשות לכך.
השורשים של האירוע מגיעים עד ליולי 2021, אז קבע הקבינט המדיני-ביטחוני כי שירות הביטחון הכללי (שב"כ) לא יהיה אחראי עוד על אבטחת הטיסות הזרות לישראל, והאחריות תועבר למשרד התחבורה. עד לאותה החלטה, השב"כ היה הגורם האחראי לאבחון הביטחוני של אנשי צוות המגיעים לישראל בטיסות זרות. בהחלטת הקבינט נקבע כי רשות התעופה האזרחית (רת"א) במשרד התחבורה תבדוק כי הנחיות האבטחה במדינות הזרות עומדות בהוראות האמנות הבינלאומיות, אולם במסמך המל"ל נכתב מפורשות כי משרד התחבורה לא פועל במסגרת ההחלטה.
לפי הדיווח, מדובר באחד המחדלים שעליהם הצביע מבקר המדינה בדו"ח סודי ממאי 2024 שהוטל עליו חיסיון. בעקבות דו"ח המבקר, קבע הקבינט המדיני-ביטחוני ב-23 במאי 2024 כי המל"ל יקים צוות בהשתתפות משרד התחבורה, רשות התעופה האזרחית, שב"כ, המוסד ומשרד האוצר, במטרה לבחון את מערך אבטחת התעופה האזרחית לישראל ולגבש המלצות לשינויים. עבודת המטה נמשכה כשנה, ובמהלכה המל"ל והשב"כ דחפו לכך שמשרד התחבורה יקבל על עצמו את האחריות הביטחונית, בגלל שבשב"כ טענו כי אין לארגון די משאבים ותקציבים לטיפול בנושא.
עימותים חריפים והכרעת ראש הממשלה
בתוך משרד התחבורה, גורמי המקצוע התנגדו נחרצות למהלך. מנהל אגף הביטחון במשרד, אברי כהן, טען בדיונים הפנימיים כי מדובר באחריות כבדה מדי וכי לנוכח רמות האיום הגבוהות בישראל נדרש גוף ביטחוני שיתכלל את הנושא. גורם המעורה בפרטי הדיונים אמר: "כל הצוות המקצועי במשרד התחבורה התנגד נחרצות להעברת הסמכויות – למעט מנהל רת"א שמואל זכאי. כולם עמדו על הרגליים האחוריות, ואמרו לשרה מירי רגב שזו תהיה טעות קשה לקחת אחריות כל כך גדולה".
הגורם הוסיף ותאר את העימותים הקשים מאחורי הקלעים: "היו פיצוצים קשים, עימותים ומכתבים חריפים – אבל השרה רגב, המנכ"ל בן זקן ומנהל רת"א זכאי לא הקשיבו. השרה הלכה עם עמדת זכאי, ובדיון שהיה להם אצל ראש הממשלה הם יצאו מהדיון כשהאחריות עברה למשרד התחבורה". באמצע שנת 2025 הכריע ראש הממשלה בנימין נתניהו בסוגיה וקבע כי האחריות תועבר באופן חד-משמעי למשרד התחבורה ולשרה רגב ואנשי הביטחון במשרד, למרות ההתנגדות של גורמי המקצוע.

חוסר פיקוח ואזהרות המל"ל
אלא שגם לאחר קבלת האחריות, אגף הביטחון במשרד התחבורה לא פנה ולו פעם אחת לשב"כ או למוסד בבקשה לסיוע באבחון ביטחוני או בתחקיר על איש צוות או נוסע בטיסה. במקביל, גם השב"כ והמוסד מצדם לא לקחו אחריות מרחיבה.
גורם המעורה בפרטים מתח ביקורת חריפה גם על גופי הביטחון ואמר: "שב"כ ומוסד ידעו היטב שמשרד התחבורה מפורק, שאין בו אנשים, שאין תקנים ואין יכולות. איך הם הסירו ככה אחריות וזרקו הכל למשרד התחבורה? האחריות היא על משרד התחבורה – אבל גם שב"כ ומוסד אפשרו את המחדל הזה והכתובת הייתה על הקיר".
לפי הדיווח, כבר במרץ 2025 התריע המל"ל שמשרד התחבורה אינו מממש את אחריותו ואף כתב מפורשות כי המשרד פועל בניגוד להחלטת הקבינט. בפועל לא בוצע הפיקוח שנועד לוודא שחברות התעופה הזרות עומדות בהסכמים הבינלאומיים, ואינן שולחות לישראל אנשי צוות ממדינות שאין לישראל יחסים דיפלומטיים עמן.